R nlmeControl nlme Fit 的控製值

R語言 nlmeControl 位於 nlme 包(package)。

說明

函數調用中提供的值替換默認值，並返回包含所有可能參數的列表。返回的列表用作nlme 函數的control 參數。

用法

nlmeControl(maxIter, pnlsMaxIter, msMaxIter, minScale,
            tolerance, niterEM, pnlsTol, msTol,
            returnObject, msVerbose, msWarnNoConv,
            gradHess, apVar, .relStep, minAbsParApVar = 0.05,
            opt = c("nlminb", "nlm"), natural = TRUE, sigma = NULL, ...)

參數

`maxIter`	`nlme` 優化算法的最大迭代次數。默認值為 50。
`pnlsMaxIter`	`nlme` 優化中 `PNLS` 優化步驟的最大迭代次數。默認值為 7。
`msMaxIter`	`nlme` 優化內的 `nlminb` ( `iter.max` ) 或 `nlm` ( `iterlim` ，從第 10 步開始) 優化步驟的最大迭代次數。默認值為 50(對於過度參數化的情況等可能太小)。
`minScale`	縮小默認步長大小以嘗試減少 `PNLS` 步驟中的平方和的最小因子。默認`0.001`。
`tolerance`	`nlme` 算法中收斂標準的容差。默認為 `1e-6` 。
`niterEM`	用於細化隨機效應方差-協方差係數的初始估計的 EM 算法的迭代次數。默認值為 25。
`pnlsTol`	`PNLS` 步驟中收斂標準的容差。默認為 `1e-3` 。
`msTol`	`nlm` 中收斂標準的容差，作為 `gradtol` 參數傳遞給函數(請參閱 `nlm` 文檔)。默認為 `1e-7` 。
`returnObject`	一個邏輯值，指示當達到最大迭代次數且算法不收斂時是否應返回擬合對象。默認為 `FALSE` 。
`msVerbose`	作為 `trace` 傳遞到 `nlminb(.., control= list(trace = *, ..))` 或作為參數 `print.level` 傳遞到 `nlm()` 的邏輯值。默認為 `FALSE` 。
`msWarnNoConv`	邏輯指示每當 LME 步驟中的最小化(通過 `opt` )不收斂時是否應發出 `warning` 信號；默認為 `TRUE` 。
`gradHess`	一個邏輯值，指示對數似然函數的數值梯度向量和 Hessian 矩陣是否應在 `nlm` 優化中使用。僅當相關結構 ( `corStruct` ) 和方差函數結構 ( `varFunc` ) 沒有 "varying" 參數且隨機效應結構中使用的 `pdMat` 類為 `pdSymm`(一般正-定)、`pdDiag`(對角線)、`pdIdent`(恒等式的倍數)或`pdCompSymm`(複合對稱)。默認為 `TRUE` 。
`apVar`	一個邏輯值，指示是否應計算方差-協方差參數的近似協方差矩陣。默認為 `TRUE` 。
`.relStep`	數值導數計算的相對步驟。默認為 `.Machine$double.eps^(1/3)` 。
`minAbsParApVar`	數值 - 近似方差計算中的最小絕對參數值。默認為 `0.05` 。
`opt`	要使用的優化器， `"nlminb"` (默認)或 `"nlm"` 。
`natural`	一個邏輯值，指示在計算估計量的近似協方差矩陣時，是否應將 `pdNatural` 參數化用於 `reStruct` 中的一般正定矩陣 (`pdSymm` )。默認為 `TRUE` 。
`sigma`	可選用正數來固定殘差。如果默認情況下 `NULL` 或 `0` ，則估計 sigma。
`...`	此外，命名控製參數將傳遞給`nlminb`(除了上麵提到的`trace`和`iter.max`)，在使用的地方(`eval.max`和`abs.tol`以下)。

值

包含每個可能參數的組件的列表。

例子

# decrease the maximum number of iterations and request tracing
nlmeControl(msMaxIter = 20, msVerbose = TRUE)

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu; the sigma option: Siem Heisterkamp and Bert van Willigen.

也可以看看

nlme , nlm , optim , nlmeStruct

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Control Values for nlme Fit。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。