R CO2 草植物的二氧化碳吸收

说明

CO2 DataFrame 有 84 行 5 列数据，来自草种稗草 crus-galli 的耐寒性实验。

用法

CO2

格式

类的对象c("nfnGroupedData", "nfGroupedData", "groupedData", "data.frame")包含以下列：

植物

级别为 Qn1 < Qn2 < Qn3 < ... < Mc1 的有序因子，为每个植物提供唯一标识符。

类型

具有 Quebec Mississippi 水平的因子给出植物的起源

治疗

具有级别 nonchilled chilled 的因子

浓度

环境二氧化碳浓度 (mL/L) 的数值向量。

摄取

二氧化碳吸收率的数值向量(\mu\mbox{mol}/m^2 秒)。

细节

在多个环境 CO_2 浓度水平下测量了来自魁北克省的六种植物和来自密西西比州的六种植物的 CO_2 吸收量。在进行实验之前，将每种类型的一半植物冷冻过夜。

该数据集最初是包 nlme 的一部分，并且具有用于其分组数据类的方法(包括 [ 、 as.data.frame 、 plot 和 print )。

例子

require(stats); require(graphics)

coplot(uptake ~ conc | Plant, data = CO2, show.given = FALSE, type = "b")
## fit the data for the first plant
fm1 <- nls(uptake ~ SSasymp(conc, Asym, lrc, c0),
   data = CO2, subset = Plant == "Qn1")
summary(fm1)
## fit each plant separately
fmlist <- list()
for (pp in levels(CO2$Plant)) {
  fmlist[[pp]] <- nls(uptake ~ SSasymp(conc, Asym, lrc, c0),
      data = CO2, subset = Plant == pp)
}
## check the coefficients by plant
print(sapply(fmlist, coef), digits = 3)

来源

Potvin, C.、Lechowicz, M. J. 和 Tardif, S. (1990)“从涉及重复测量的实验中获得的生态生理响应曲线的统计分析”，《生态学》，71, 1389-1400。

Pinheiro, J. C. 和 Bates, D. M. (2000) S 和 S-PLUS 中的混合效应模型，Springer。