R CO2 草植物的二氧化碳吸收

說明

CO2 DataFrame 有 84 行 5 列數據，來自草種稗草 crus-galli 的耐寒性實驗。

用法

CO2

格式

類的對象c("nfnGroupedData", "nfGroupedData", "groupedData", "data.frame")包含以下列：

植物

級別為 Qn1 < Qn2 < Qn3 < ... < Mc1 的有序因子，為每個植物提供唯一標識符。

類型

具有 Quebec Mississippi 水平的因子給出植物的起源

治療

具有級別 nonchilled chilled 的因子

濃度

環境二氧化碳濃度 (mL/L) 的數值向量。

攝取

二氧化碳吸收率的數值向量(\mu\mbox{mol}/m^2 秒)。

細節

在多個環境 CO_2 濃度水平下測量了來自魁北克省的六種植物和來自密西西比州的六種植物的 CO_2 吸收量。在進行實驗之前，將每種類型的一半植物冷凍過夜。

該數據集最初是包 nlme 的一部分，並且具有用於其分組數據類的方法(包括 [ 、 as.data.frame 、 plot 和 print )。

例子

require(stats); require(graphics)

coplot(uptake ~ conc | Plant, data = CO2, show.given = FALSE, type = "b")
## fit the data for the first plant
fm1 <- nls(uptake ~ SSasymp(conc, Asym, lrc, c0),
   data = CO2, subset = Plant == "Qn1")
summary(fm1)
## fit each plant separately
fmlist <- list()
for (pp in levels(CO2$Plant)) {
  fmlist[[pp]] <- nls(uptake ~ SSasymp(conc, Asym, lrc, c0),
      data = CO2, subset = Plant == pp)
}
## check the coefficients by plant
print(sapply(fmlist, coef), digits = 3)

來源

Potvin, C.、Lechowicz, M. J. 和 Tardif, S. (1990)“從涉及重複測量的實驗中獲得的生態生理響應曲線的統計分析”，《生態學》，71, 1389-1400。

Pinheiro, J. C. 和 Bates, D. M. (2000) S 和 S-PLUS 中的混合效應模型，Springer。