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Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法代码示例

本文整理汇总了Python中oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的具体用法?Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap怎么用?Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils的用法示例。


在下文中一共展示了TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: _determine_if_cds_overlap

# 需要导入模块: from oncotator.TranscriptProviderUtils import TranscriptProviderUtils [as 别名]
# 或者: from oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils import test_feature_overlap [as 别名]
 def _determine_if_cds_overlap(self, s, e, tx, variant_type):
     if variant_type == VariantClassification.VT_INS:
         is_cds_overlap = TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, s, tx.get_cds()) != -1
     else:
         is_cds_overlap = TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, e, tx.get_cds()) != -1
     return is_cds_overlap
开发者ID:alexramos,项目名称:oncotator,代码行数:8,代码来源:VariantClassifier.py

示例2: _determine_exon_index

# 需要导入模块: from oncotator.TranscriptProviderUtils import TranscriptProviderUtils [as 别名]
# 或者: from oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils import test_feature_overlap [as 别名]
 def _determine_exon_index(self, s, e, tx, variant_type):
     if variant_type != VariantClassification.VT_INS:
         return TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, e, tx.get_exons())
     else:
         return TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, s, tx.get_exons())
开发者ID:dhlbh,项目名称:oncotator,代码行数:7,代码来源:VariantClassifier.py


注:本文中的oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。