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Python Molecule.qm_forces方法代码示例

本文整理汇总了Python中forcebalance.molecule.Molecule.qm_forces方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Molecule.qm_forces方法的具体用法?Python Molecule.qm_forces怎么用?Python Molecule.qm_forces使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在forcebalance.molecule.Molecule的用法示例。


在下文中一共展示了Molecule.qm_forces方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: gather_generations

# 需要导入模块: from forcebalance.molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from forcebalance.molecule.Molecule import qm_forces [as 别名]
def gather_generations():
    shots = Molecule('shots.gro')
    qdata = Molecule('qdata.txt')
    A1    = np.array(shots.xyzs)
    A2    = np.array(qdata.xyzs)
    if A1.shape != A2.shape:
        raise Exception('shots.gro and qdata.txt appear to contain different data')
    elif np.max(np.abs((A1 - A2).flatten())) > 1e-4:
        raise Exception('shots.gro and qdata.txt appear to contain different xyz coordinates')
    shots.qm_energies = qdata.qm_energies
    shots.qm_forces   = qdata.qm_forces
    shots.qm_espxyzs     = qdata.qm_espxyzs
    shots.qm_espvals     = qdata.qm_espvals
    First = True
    if First:
        All = shots
    else:
        All += shots
    return All
开发者ID:leeping,项目名称:forcebalance,代码行数:21,代码来源:GenerateQMData.py


注:本文中的forcebalance.molecule.Molecule.qm_forces方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。