本文整理汇总了Python中forcebalance.molecule.Molecule.qm_energies方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.qm_energies方法的具体用法？Python Molecule.qm_energies怎么用？Python Molecule.qm_energies使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类forcebalance.molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.qm_energies方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: gather_generations
# 需要导入模块: from forcebalance.molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from forcebalance.molecule.Molecule import qm_energies [as 别名]
def gather_generations():
shots = Molecule('shots.gro')
qdata = Molecule('qdata.txt')
A1 = np.array(shots.xyzs)
A2 = np.array(qdata.xyzs)
if A1.shape != A2.shape:
raise Exception('shots.gro and qdata.txt appear to contain different data')
elif np.max(np.abs((A1 - A2).flatten())) > 1e-4:
raise Exception('shots.gro and qdata.txt appear to contain different xyz coordinates')
shots.qm_energies = qdata.qm_energies
shots.qm_forces = qdata.qm_forces
shots.qm_espxyzs = qdata.qm_espxyzs
shots.qm_espvals = qdata.qm_espvals
First = True
if First:
All = shots
else:
All += shots
return All