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Python Molecule.edit_qcrems方法代码示例

本文整理汇总了Python中forcebalance.molecule.Molecule.edit_qcrems方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Molecule.edit_qcrems方法的具体用法?Python Molecule.edit_qcrems怎么用?Python Molecule.edit_qcrems使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在forcebalance.molecule.Molecule的用法示例。


在下文中一共展示了Molecule.edit_qcrems方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: int

# 需要导入模块: from forcebalance.molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from forcebalance.molecule.Molecule import edit_qcrems [as 别名]
#!/usr/bin/env python

from forcebalance.molecule import Molecule
from forcebalance.nifty import _exec
import os

np=""
if "CORES_PER_WORKER" in os.environ and int(os.environ["CORES_PER_WORKER"]) > 1:
    np=" -np %i" % int(os.environ["CORES_PER_WORKER"])

_exec("touch opt.xyz")
_exec("touch energy.txt")
_exec("rm -f qchem.out.prev")
_exec("touch qchem.out.prev")
qcin = Molecule("qchem.in", ftype="qcin")
qcin.edit_qcrems({'geom_opt_max_cycles':'100'})
qcin.write("qchem.in")
_exec("qchem42 %s qchem.in qchem.out &> qchem.err" % np)

def special_criterion():
    mk = 0
    mx = 0
    Cnvgd = {}
    for ln, line in enumerate(open("qchem.out").readlines()):
        if "Maximum optimization cycles reached" in line:
            mx = 1
        if "Maximum     Tolerance    Cnvgd?" in line:
            mk = ln
        if mk > 0 and ln > mk and ln <= mk+3:
            s = line.split()
            try:
开发者ID:ChayaSt,项目名称:open-forcefield-group,代码行数:33,代码来源:opt-qchem.py


注:本文中的forcebalance.molecule.Molecule.edit_qcrems方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。