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Python TitleAlignments.worstHsp方法代码示例

本文整理汇总了Python中dark.titles.TitleAlignments.worstHsp方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TitleAlignments.worstHsp方法的具体用法?Python TitleAlignments.worstHsp怎么用?Python TitleAlignments.worstHsp使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在dark.titles.TitleAlignments的用法示例。


在下文中一共展示了TitleAlignments.worstHsp方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: testWorstHsp

# 需要导入模块: from dark.titles import TitleAlignments [as 别名]
# 或者: from dark.titles.TitleAlignments import worstHsp [as 别名]
 def testWorstHsp(self):
     """
     The worstHsp function must return the HSP with the worst score for all
     the HSPs for all the alignments matching a title.
     """
     hsp1 = LSP(7)
     hsp2 = LSP(15)
     hsp3 = LSP(21)
     titleAlignments = TitleAlignments('subject title', 55)
     read = Read('id1', 'AAA')
     titleAlignment = TitleAlignment(read, [hsp1, hsp2])
     titleAlignments.addAlignment(titleAlignment)
     read = Read('id2', 'AAA')
     titleAlignment = TitleAlignment(read, [hsp3])
     titleAlignments.addAlignment(titleAlignment)
     self.assertEqual(hsp3, titleAlignments.worstHsp())
开发者ID:terrycojones,项目名称:dark-matter,代码行数:18,代码来源:test_titles.py


注:本文中的dark.titles.TitleAlignments.worstHsp方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。