本文整理汇总了Python中dark.titles.TitleAlignments.summary方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TitleAlignments.summary方法的具体用法?Python TitleAlignments.summary怎么用?Python TitleAlignments.summary使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类dark.titles.TitleAlignments
的用法示例。
在下文中一共展示了TitleAlignments.summary方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: testSummary
# 需要导入模块: from dark.titles import TitleAlignments [as 别名]
# 或者: from dark.titles.TitleAlignments import summary [as 别名]
def testSummary(self):
"""
The summary method must return the correct result.
"""
titleAlignments = TitleAlignments('subject title', 10)
titleAlignments.addAlignment(
TitleAlignment(Read('id1', 'ACGT'), [
HSP(30, subjectStart=0, subjectEnd=2),
]))
titleAlignments.addAlignment(
TitleAlignment(Read('id2', 'ACGT'), [
HSP(55, subjectStart=2, subjectEnd=4),
HSP(40, subjectStart=8, subjectEnd=9),
]))
self.assertEqual(
{
'bestScore': 55,
'coverage': 0.5,
'hspCount': 3,
'medianScore': 40,
'readCount': 2,
'subjectLength': 10,
'subjectTitle': 'subject title',
},
titleAlignments.summary())