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Python TitleAlignments.summary方法代码示例

本文整理汇总了Python中dark.titles.TitleAlignments.summary方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TitleAlignments.summary方法的具体用法?Python TitleAlignments.summary怎么用?Python TitleAlignments.summary使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在dark.titles.TitleAlignments的用法示例。


在下文中一共展示了TitleAlignments.summary方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: testSummary

# 需要导入模块: from dark.titles import TitleAlignments [as 别名]
# 或者: from dark.titles.TitleAlignments import summary [as 别名]
 def testSummary(self):
     """
     The summary method must return the correct result.
     """
     titleAlignments = TitleAlignments('subject title', 10)
     titleAlignments.addAlignment(
         TitleAlignment(Read('id1', 'ACGT'), [
             HSP(30, subjectStart=0, subjectEnd=2),
         ]))
     titleAlignments.addAlignment(
         TitleAlignment(Read('id2', 'ACGT'), [
             HSP(55, subjectStart=2, subjectEnd=4),
             HSP(40, subjectStart=8, subjectEnd=9),
         ]))
     self.assertEqual(
         {
             'bestScore': 55,
             'coverage': 0.5,
             'hspCount': 3,
             'medianScore': 40,
             'readCount': 2,
             'subjectLength': 10,
             'subjectTitle': 'subject title',
         },
         titleAlignments.summary())
开发者ID:terrycojones,项目名称:dark-matter,代码行数:27,代码来源:test_titles.py


注:本文中的dark.titles.TitleAlignments.summary方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。