本文整理汇总了Python中clustergrammer.Network.filter_network_thresh方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Network.filter_network_thresh方法的具体用法?Python Network.filter_network_thresh怎么用?Python Network.filter_network_thresh使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类clustergrammer.Network
的用法示例。
在下文中一共展示了Network.filter_network_thresh方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Network
# 需要导入模块: from clustergrammer import Network [as 别名]
# 或者: from clustergrammer.Network import filter_network_thresh [as 别名]
# import network class from Network.py
from clustergrammer import Network
# get instance of Network
net = Network()
print(net.__doc__)
print('make tsv clustergram')
# load network from tsv file
##############################
net.load_tsv_to_net('txt/example_tsv_network.txt')
inst_filt = 0.001
inst_meet = 1
net.filter_network_thresh(inst_filt,inst_meet)
# cluster
#############
net.cluster_row_and_col('cos')
# export data visualization to file
######################################
net.write_json_to_file('viz', 'json/default_example.json', 'indent')