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Python Network.add_cats方法代码示例

本文整理汇总了Python中clustergrammer.Network.add_cats方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Network.add_cats方法的具体用法?Python Network.add_cats怎么用?Python Network.add_cats使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在clustergrammer.Network的用法示例。


在下文中一共展示了Network.add_cats方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: prepare_heatmap

# 需要导入模块: from clustergrammer import Network [as 别名]
# 或者: from clustergrammer.Network import add_cats [as 别名]
def prepare_heatmap(matrix_input, html_file, html_dir, tools_dir, categories, distance, linkage):
    # prepare directory and html
    os.mkdir(html_dir)

    env = Environment(loader=FileSystemLoader(tools_dir + "/templates"))
    template = env.get_template("clustergrammer.template")
    overview = template.render()
    with open(html_file, "w") as outf:
        outf.write(overview)

    json_output = html_dir + "/mult_view.json"

    net = Network()
    net.load_file(matrix_input)
    if (categories['row']):
        net.add_cats('row', categories['row'])
    if (categories['col']):
        net.add_cats('col', categories['col'])
    net.cluster(dist_type=distance, linkage_type=linkage)
    net.write_json_to_file('viz', json_output)
开发者ID:ImmPortDB,项目名称:immport-galaxy,代码行数:22,代码来源:clustergrammerIPG.py


注:本文中的clustergrammer.Network.add_cats方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。