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Python Population.individual_with_column方法代码示例

本文整理汇总了Python中Population.Population.individual_with_column方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Population.individual_with_column方法的具体用法?Python Population.individual_with_column怎么用?Python Population.individual_with_column使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Population.Population的用法示例。


在下文中一共展示了Population.individual_with_column方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: sorted

# 需要导入模块: from Population import Population [as 别名]
# 或者: from Population.Population import individual_with_column [as 别名]
        gd_util.die('There is an individual in the population individuals that is not in the Coverage table')


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prog = 'mito_draw'

args = [ prog ]
args.append(snp_file)
args.append(cov_file)
args.append(annotation_input)
args.append(min_coverage)

if order_p_ind:
    for column in sorted(p_ind.column_list()):
        individual = p_ind.individual_with_column(column)
        name = individual.name.split()[0]
        args.append('{0}:{1}:{2}'.format(0, column, name))
else:
    append_tags(args, p_ind, 'gd_indivs', 0)

append_tags(args, p_snp, snp_ext, 1)
append_tags(args, p_cov, cov_ext, 2)

with open('Ji.spec', 'w') as fh:
    gd_util.run_program(prog, args, stdout=fh)

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prog = 'varplot'
开发者ID:gigascience,项目名称:galaxy-genome-diversity,代码行数:32,代码来源:draw_variants.py


注:本文中的Population.Population.individual_with_column方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。