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R summary.lme 总结一个 lme 对象


R语言 summary.lme 位于 nlme 包(package)。

说明

有关由 object 表示的线性混合效应拟合的附加信息被提取并包含为 object 的组件。返回的对象具有 printcoef 方法,后者返回系数的 tTtable

用法

## S3 method for class 'lme'
summary(object, adjustSigma, verbose, ...)
## S3 method for class 'summary.lme'
print(x, verbose = FALSE, ...)

参数

object

继承自类 "lme" 的对象,表示拟合的线性混合效果模型。

adjustSigma

可选的逻辑值。如果 TRUE 和用于获取 object 的估计方法是最大似然,则将残余标准误差乘以 ,将其转换为 REML-like 估计值。仅当将单个拟合对象传递给函数时才使用此参数。默认为 TRUE

verbose

用于控制 print.summary.lme 方法中的输出量的可选逻辑值。默认为 FALSE

...

传递给方法的附加可选参数,主要用于 print 方法。

x

"summary.lme" 对象。

一个继承自类 summary.lme 的对象,其中包含 object 中包含的所有组件(有关组件的完整说明,请参阅 lmeObject)以及以下组件:

corFixed

固定效应估计的近似相关矩阵。

tTable

一个矩阵,其中列名为 ValueStd. ErrorDFt-valuep-value 分别表示固定效应估计值、它们的近似标准误差、分母自由度、估计值与它们之间的比率标准误以及 t 分布的相关 p 值。行对应于不同的固定效应。

residuals

如果 lme 拟合中使用了五个以上的观测值,则为具有最内分组水平残差分布的最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数和最大值的向量;否则是最里面的分组级别残差。

AIC

对应于 object 的赤池信息准则。

BIC

对应于 object 的贝叶斯信息准则。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
(s1 <- summary(fm1))
coef(s1) # the (coef | Std.E | t | P-v ) matrix

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

也可以看看

AICBIClme

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注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Summarize an lme Object。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。