R batchSOM 自组织映射：批处理算法

说明

Kohonen 的Self-Organizing Map是多维缩放的粗略形式。

用法

batchSOM(data, grid = somgrid(), radii, init)

参数

data	观察值的矩阵或 DataFrame ，经过缩放以使欧几里得距离合适。
grid	代表网格：参见somgrid。
radii	用于每次传递的邻域半径：为 radii 的每个元素运行一次传递。
init	最初的代表。如果丢失，则从 data 中随机选择(不替换)。

细节

使用 Kohonen(1995，第 3.14 节)的批量 SOM 算法。

值

带有组件的 "SOM" 类的对象

grid	网格，类 "somgrid" 的对象。
codes	代表矩阵。

例子

require(graphics)
data(crabs, package = "MASS")

lcrabs <- log(crabs[, 4:8])
crabs.grp <- factor(c("B", "b", "O", "o")[rep(1:4, rep(50,4))])
gr <- somgrid(topo = "hexagonal")
crabs.som <- batchSOM(lcrabs, gr, c(4, 4, 2, 2, 1, 1, 1, 0, 0))
plot(crabs.som)

bins <- as.numeric(knn1(crabs.som$codes, lcrabs, 0:47))
plot(crabs.som$grid, type = "n")
symbols(crabs.som$grid$pts[, 1], crabs.som$grid$pts[, 2],
        circles = rep(0.4, 48), inches = FALSE, add = TRUE)
text(crabs.som$grid$pts[bins, ] + rnorm(400, 0, 0.1),
     as.character(crabs.grp))

参考

Kohonen, T. (1995) Self-Organizing Maps. Springer-Verlag.

Ripley, B. D. (1996) Pattern Recognition and Neural Networks. Cambridge.

Venables, W. N. and Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.

也可以看看

somgrid , SOM