R batchSOM 自組織映射：批處理算法

說明

Kohonen 的Self-Organizing Map是多維縮放的粗略形式。

用法

batchSOM(data, grid = somgrid(), radii, init)

參數

data	觀察值的矩陣或 DataFrame ，經過縮放以使歐幾裏得距離合適。
grid	代表網格：參見somgrid。
radii	用於每次傳遞的鄰域半徑：為 radii 的每個元素運行一次傳遞。
init	最初的代表。如果丟失，則從 data 中隨機選擇(不替換)。

細節

使用 Kohonen(1995，第 3.14 節)的批量 SOM 算法。

值

帶有組件的 "SOM" 類的對象

grid	網格，類 "somgrid" 的對象。
codes	代表矩陣。

例子

require(graphics)
data(crabs, package = "MASS")

lcrabs <- log(crabs[, 4:8])
crabs.grp <- factor(c("B", "b", "O", "o")[rep(1:4, rep(50,4))])
gr <- somgrid(topo = "hexagonal")
crabs.som <- batchSOM(lcrabs, gr, c(4, 4, 2, 2, 1, 1, 1, 0, 0))
plot(crabs.som)

bins <- as.numeric(knn1(crabs.som$codes, lcrabs, 0:47))
plot(crabs.som$grid, type = "n")
symbols(crabs.som$grid$pts[, 1], crabs.som$grid$pts[, 2],
        circles = rep(0.4, 48), inches = FALSE, add = TRUE)
text(crabs.som$grid$pts[bins, ] + rnorm(400, 0, 0.1),
     as.character(crabs.grp))

參考

Kohonen, T. (1995) Self-Organizing Maps. Springer-Verlag.

Ripley, B. D. (1996) Pattern Recognition and Neural Networks. Cambridge.

Venables, W. N. and Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.

也可以看看

somgrid , SOM