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Python MinHash.add_protein方法代码示例

本文整理汇总了Python中sourmash._minhash.MinHash.add_protein方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python MinHash.add_protein方法的具体用法?Python MinHash.add_protein怎么用?Python MinHash.add_protein使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在sourmash._minhash.MinHash的用法示例。


在下文中一共展示了MinHash.add_protein方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_bytes_protein

# 需要导入模块: from sourmash._minhash import MinHash [as 别名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 别名]
def test_bytes_protein(track_abundance):
    # verify that we can hash protein/aa sequences
    mh = MinHash(10, 6, True, track_abundance=track_abundance)
    mh.add_protein('AGYYG')
    mh.add_protein(u'AGYYG')
    mh.add_protein(b'AGYYG')

    assert len(mh.get_mins()) == 4
开发者ID:dib-lab,项目名称:sourmash,代码行数:10,代码来源:test__minhash.py

示例2: test_basic_dna_bad_2

# 需要导入模块: from sourmash._minhash import MinHash [as 别名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 别名]
def test_basic_dna_bad_2(track_abundance):
    # test behavior on bad DNA
    mh = MinHash(1, 6, track_abundance=track_abundance)

    with pytest.raises(ValueError):
        mh.add_protein('YYYY')
开发者ID:dib-lab,项目名称:sourmash,代码行数:8,代码来源:test__minhash.py

示例3: test_protein_short

# 需要导入模块: from sourmash._minhash import MinHash [as 别名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 别名]
def test_protein_short(track_abundance):
    # verify that we can hash protein/aa sequences
    mh = MinHash(10, 9, True, track_abundance=track_abundance)
    mh.add_protein('AG')

    assert len(mh.get_mins()) == 0, mh.get_mins()
开发者ID:dib-lab,项目名称:sourmash,代码行数:8,代码来源:test__minhash.py


注:本文中的sourmash._minhash.MinHash.add_protein方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。