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Python EBISubmission.write_sample_xml方法代码示例

本文整理汇总了Python中qiita_ware.ebi.EBISubmission.write_sample_xml方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python EBISubmission.write_sample_xml方法的具体用法?Python EBISubmission.write_sample_xml怎么用?Python EBISubmission.write_sample_xml使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在qiita_ware.ebi.EBISubmission的用法示例。


在下文中一共展示了EBISubmission.write_sample_xml方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_write_sample_xml

# 需要导入模块: from qiita_ware.ebi import EBISubmission [as 别名]
# 或者: from qiita_ware.ebi.EBISubmission import write_sample_xml [as 别名]
    def test_write_sample_xml(self):
        submission = EBISubmission('001', 'teststudy', 'test asbstract',
                                   'metagenome')
        submission.add_sample('test1')
        submission.add_sample('test2')
        fh, output = mkstemp()
        close(fh)
        submission.write_sample_xml(output)

        obs_stripped = ''.join([l.strip() for l in open(output)])
        exp_stripped = ''.join([l.strip() for l in SAMPLEXML.splitlines()])
        self.assertEqual(obs_stripped, exp_stripped)
        remove(output)
开发者ID:Jorge-C,项目名称:qiita,代码行数:15,代码来源:test_ebi.py

示例2: test_write_sample_xml

# 需要导入模块: from qiita_ware.ebi import EBISubmission [as 别名]
# 或者: from qiita_ware.ebi.EBISubmission import write_sample_xml [as 别名]
    def test_write_sample_xml(self):
        submission = EBISubmission('001', 'teststudy', 'test asbstract',
                                   investigation_type='Other',
                                   new_investigation_type='metagenome')
        submission.add_sample('test1', '9606', 'homo sapiens', 'desc1')
        submission.add_sample('test2', '9606', 'homo sapiens', 'desc2')
        fh, output = mkstemp()
        close(fh)
        submission.write_sample_xml(output)

        obs_stripped = ''.join([l.strip() for l in open(output)])
        exp_stripped = ''.join([l.strip() for l in SAMPLEXML.splitlines()])
        self.assertEqual(obs_stripped, exp_stripped)
        remove(output)
开发者ID:MarkBruns,项目名称:qiita,代码行数:16,代码来源:test_ebi.py


注:本文中的qiita_ware.ebi.EBISubmission.write_sample_xml方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。