Python BedTool.pair_to_bed方法代码示例

本文整理汇总了Python中pybedtools.BedTool.pair_to_bed方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python BedTool.pair_to_bed方法的具体用法？Python BedTool.pair_to_bed怎么用？Python BedTool.pair_to_bed使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pybedtools.BedTool的用法示例。

在下文中一共展示了BedTool.pair_to_bed方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: overlap_pe

# 需要导入模块: from pybedtools import BedTool [as 别名]
# 或者: from pybedtools.BedTool import pair_to_bed [as 别名]
def overlap_pe(variants_bedpe_file, gtf_file, result_file):
    variants_bed = BedTool(variants_bedpe_file)
    gtf = BedTool(gtf_file)
    olaps = variants_bed.pair_to_bed(gtf, stream=True).moveto(result_file)

注：本文中的pybedtools.BedTool.pair_to_bed方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。