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Python BedTool.introns方法代码示例

本文整理汇总了Python中pybedtools.BedTool.introns方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python BedTool.introns方法的具体用法?Python BedTool.introns怎么用?Python BedTool.introns使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pybedtools.BedTool的用法示例。


在下文中一共展示了BedTool.introns方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: BedTool

# 需要导入模块: from pybedtools import BedTool [as 别名]
# 或者: from pybedtools.BedTool import introns [as 别名]
import argparse
from pybedtools import BedTool


if __name__ == "__main__":
    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("bed12")
    parser.add_argument("introns")
    args = parser.parse_args()

    bed = BedTool(args.bed12)
    introns = bed.introns()
    introns.remove_invalid().saveas(args.introns)
开发者ID:huddlej,项目名称:fasta_tools,代码行数:15,代码来源:refGene_bed12_to_introns.py


注:本文中的pybedtools.BedTool.introns方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。