本文整理汇总了Python中pybedtools.BedTool.all_hits方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python BedTool.all_hits方法的具体用法？Python BedTool.all_hits怎么用？Python BedTool.all_hits使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pybedtools.BedTool的用法示例。
在下文中一共展示了BedTool.all_hits方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: print_split_sort_bed
# 需要导入模块: from pybedtools import BedTool [as 别名]
# 或者: from pybedtools.BedTool import all_hits [as 别名]
pass
def print_split_sort_bed(self):
pass
split_num = 100
split_region_list = [[]*5]
print split_region_list
bed = BedTool('/Users/huangzhibo/workitems/10.testData/testPlatformTJ/bed/test.bed')
bed = BedTool(bed.sort().merge().window_maker(b=bed.fn, w=100))
bed.all_hits()
# x = BedTool().window_maker(genome='hg38', w=1000000)
bed.saveas('/Users/huangzhibo/workitems/10.testData/testPlatformTJ/bed/test_w100.bed')
split_num = bed.count() if bed.count() < split_num else split_num
print bed.count()/split_num
# print bed.split(10, 'out')
# print x
n = 0
for region in bed:
# print region.length