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Python Tree.sort_descendants方法代码示例

本文整理汇总了Python中ete3.Tree.sort_descendants方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Tree.sort_descendants方法的具体用法?Python Tree.sort_descendants怎么用?Python Tree.sort_descendants使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在ete3.Tree的用法示例。


在下文中一共展示了Tree.sort_descendants方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: zip

# 需要导入模块: from ete3 import Tree [as 别名]
# 或者: from ete3.Tree import sort_descendants [as 别名]
#!/usr/bin/python
from ete3 import Tree, NodeStyle
from pyies.userOptions import basePath
import os.path

spTree1F = os.path.join(basePath, 'analysis', 'iesdb', 'speciesTree1.nhx')
spTree2F = os.path.join(basePath, 'analysis', 'iesdb', 'speciesTree2.nhx')
spTree3F = os.path.join(basePath, 'analysis', 'iesdb', 'speciesTree3b.nhx')
outT1 = os.path.join(basePath, 'analysis', 'figures', 'spTree1.png')
outT2 = os.path.join(basePath, 'analysis', 'figures', 'spTree2.png')
outT3 = os.path.join(basePath, 'analysis', 'figures', 'spTree3.png')

for tF, oF in zip([spTree1F, spTree2F, spTree3F], [outT1, outT2, outT3]):
    t = Tree(tF)
    t.sort_descendants(attr='O')
    for node in t.traverse():
        nstyle = NodeStyle()
        nstyle["size"] = 0
        node.set_style(nstyle)
    #t.show()
    t.render(oF)
开发者ID:,项目名称:,代码行数:23,代码来源:


注:本文中的ete3.Tree.sort_descendants方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。