本文整理汇总了Python中ete3.Tree.get_leaves_by_name方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Tree.get_leaves_by_name方法的具体用法？Python Tree.get_leaves_by_name怎么用？Python Tree.get_leaves_by_name使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ete3.Tree的用法示例。
在下文中一共展示了Tree.get_leaves_by_name方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Tree
# 需要导入模块: from ete3 import Tree [as 别名]
# 或者: from ete3.Tree import get_leaves_by_name [as 别名]
parser.add_argument('--nosupport', action='store_true', default="", help="Hide branch support")
parser.add_argument('-c',dest='circular', action='store_true', default="", help="Draw a circular tree ")
args, unknown = parser.parse_known_args()
t = Tree(args.i)
ts = TreeStyle()
if args.colorleaf:
with open(args.colorleaf,'rU') as file_map:
for line in file_map:
if line:
leaf_color = list(map(str.strip,line.split('\t')))
print leaf_color
for leaf in t.get_leaves_by_name(leaf_color[0]):
leaf.set_style(NodeStyle())
if leaf.name == leaf_color[0]:
leaf.img_style["bgcolor"] = leaf_color[1]
ts.show_leaf_name = not args.noleaf
ts.show_branch_length = not args.nolength
ts.show_branch_support = not args.nosupport
if args.circular:
ts.mode = "c"
ext="svg"
if args.ext:
ext = args.ext