本文整理汇总了Python中Bio.Phylo.Consensus.bootstrap_trees方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Consensus.bootstrap_trees方法的具体用法?Python Consensus.bootstrap_trees怎么用?Python Consensus.bootstrap_trees使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.Phylo.Consensus
的用法示例。
在下文中一共展示了Consensus.bootstrap_trees方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_bootstrap_trees
# 需要导入模块: from Bio.Phylo import Consensus [as 别名]
# 或者: from Bio.Phylo.Consensus import bootstrap_trees [as 别名]
def test_bootstrap_trees(self):
calculator = DistanceCalculator('blosum62')
constructor = DistanceTreeConstructor(calculator)
trees = list(Consensus.bootstrap_trees(self.msa, 100, constructor))
self.assertEqual(len(trees), 100)
self.assertTrue(isinstance(trees[0], BaseTree.Tree))