本文整理汇总了Python中Bio.Phylo.Consensus._count_clades方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Consensus._count_clades方法的具体用法?Python Consensus._count_clades怎么用?Python Consensus._count_clades使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.Phylo.Consensus
的用法示例。
在下文中一共展示了Consensus._count_clades方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_count_clades
# 需要导入模块: from Bio.Phylo import Consensus [as 别名]
# 或者: from Bio.Phylo.Consensus import _count_clades [as 别名]
def test_count_clades(self):
bitstr_counts = Consensus._count_clades(self.trees)
self.assertEqual(len(bitstr_counts), 6)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('11111')][0], 3)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('11000')][0], 2)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('00111')][0], 3)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('00110')][0], 2)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('00011')][0], 1)
self.assertEqual(bitstr_counts[_BitString('01111')][0], 1)