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C++ TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse方法代码示例

本文整理汇总了C++中TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse方法的具体用法?C++ TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse怎么用?C++ TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在TopSegmentIteratorConstPtr的用法示例。


在下文中一共展示了TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: checkCallBack

void MappedSegmentMapUpTest::checkCallBack(AlignmentConstPtr alignment)
{
  validateAlignment(alignment);
  const Genome* child1 = alignment->openGenome("child1");
  const Genome* child2 = alignment->openGenome("child2");
  TopSegmentIteratorConstPtr top = child2->getTopSegmentIterator();
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  top->slice(1,2);
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  top->toReverse();
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  top = child1->getTopSegmentIterator();
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  top->slice(1,2);
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  top->toReverse();
  testTopSegment(alignment, top, "parent");
  
  const Genome* g1 = alignment->openGenome("g1");
  for (hal_size_t i = 0; i < g1->getNumTopSegments(); ++i)
  {
    top = g1->getTopSegmentIterator(i);
    testTopSegment(alignment, top, "parent");
    top->slice(1,0);
    testTopSegment(alignment, top, "parent");
    top->toReverse();
    testTopSegment(alignment, top, "parent");
    top->slice(0,1);
    testTopSegment(alignment, top, "parent");
    top->toReverse();
    testTopSegment(alignment, top, "parent");
  }
}
开发者ID:dayin1989,项目名称:hal,代码行数:33,代码来源:halMappedSegmentTest.cpp

示例2: checkCallBack

void TopSegmentSequenceTest::checkCallBack(AlignmentConstPtr alignment)
{
  const Genome* ancGenome = alignment->openGenome("Anc0");
  TopSegmentIteratorConstPtr tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(100);
  CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getTopSegment()->getStartPosition() == 500);
  CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getTopSegment()->getLength() == 9);
  string seq;
  tsIt->getString(seq);
  CuAssertTrue(_testCase, seq == "CACACATTC");
  tsIt->toReverse();
  tsIt->getString(seq);
  CuAssertTrue(_testCase, seq == "GAATGTGTG");
}
开发者ID:BioinformaticsArchive,项目名称:hal,代码行数:13,代码来源:halTopSegmentTest.cpp


注:本文中的TopSegmentIteratorConstPtr::toReverse方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。