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C++ TopSegmentIteratorConstPtr::equals方法代码示例

本文整理汇总了C++中TopSegmentIteratorConstPtr::equals方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ TopSegmentIteratorConstPtr::equals方法的具体用法?C++ TopSegmentIteratorConstPtr::equals怎么用?C++ TopSegmentIteratorConstPtr::equals使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在TopSegmentIteratorConstPtr的用法示例。


在下文中一共展示了TopSegmentIteratorConstPtr::equals方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: CuAssertTrue

void 
GappedSegmentSimpleIteratorTest::checkCallBack(AlignmentConstPtr alignment)
{
  const Genome* child = alignment->openGenome("child");
  const Genome* parent = alignment->openGenome("parent");

  GappedTopSegmentIteratorConstPtr gtsIt = 
     child->getGappedTopSegmentIterator(0, 9999999);
  GappedBottomSegmentIteratorConstPtr gbsIt = 
     parent->getGappedBottomSegmentIterator(0, 0, 9999999);
  GappedTopSegmentIteratorConstPtr gtsItRev = 
     child->getGappedTopSegmentIterator(0, 9999999);
  gtsItRev->toReverse();
  GappedBottomSegmentIteratorConstPtr gbsItRev = 
     parent->getGappedBottomSegmentIterator(0, 0, 9999999);
  gbsItRev->toReverse();

  for (size_t i = 0; i < child->getNumTopSegments(); ++i)
  {
    TopSegmentIteratorConstPtr tsIt = gtsIt->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, tsIt->equals(gtsIt->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, 
                 (size_t)tsIt->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
    gtsIt->toRight();

    BottomSegmentIteratorConstPtr bsIt = gbsIt->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, bsIt->equals(gbsIt->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, 
                 (size_t)bsIt->getBottomSegment()->getArrayIndex() == i);
    gbsIt->toRight();

    TopSegmentIteratorConstPtr tsItRev = gtsItRev->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, tsItRev->equals(gtsItRev->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, 
                 (size_t)tsItRev->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
    gtsItRev->toLeft();

    BottomSegmentIteratorConstPtr bsItRev = gbsItRev->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, bsItRev->equals(gbsItRev->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, 
                 (size_t)bsItRev->getBottomSegment()->getArrayIndex() == i);
    gbsItRev->toLeft();
  }

  gtsIt = child->getGappedTopSegmentIterator(
    child->getNumTopSegments() - 1, 9999999);
  gbsIt = parent->getGappedBottomSegmentIterator(
    child->getNumTopSegments() - 1, 0, 9999999);
  gtsItRev = child->getGappedTopSegmentIterator(
    child->getNumTopSegments() - 1, 9999999);
  gtsItRev->toReverse();
  gbsItRev = parent->getGappedBottomSegmentIterator(
    child->getNumTopSegments() - 1, 0, 9999999);
  gbsItRev->toReverse();

  for (hal_index_t i = child->getNumTopSegments() - 1; i >= 0; --i)
  {
    TopSegmentIteratorConstPtr tsIt = gtsIt->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, tsIt->equals(gtsIt->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
    CuAssertTrue(_testCase, gtsIt->getReversed() == false);
    gtsIt->toLeft();

    BottomSegmentIteratorConstPtr bsIt = gbsIt->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, bsIt->equals(gbsIt->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, bsIt->getBottomSegment()->getArrayIndex() == i);
    CuAssertTrue(_testCase, gbsIt->getReversed() == false);
    gbsIt->toLeft();

    TopSegmentIteratorConstPtr tsItRev = gtsItRev->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, tsItRev->equals(gtsItRev->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, tsItRev->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
    CuAssertTrue(_testCase, gtsItRev->getReversed() == true);
    gtsItRev->toRight();

    BottomSegmentIteratorConstPtr bsItRev = gbsItRev->getLeft();
    CuAssertTrue(_testCase, bsItRev->equals(gbsItRev->getRight()));
    CuAssertTrue(_testCase, bsItRev->getBottomSegment()->getArrayIndex() == i);
    CuAssertTrue(_testCase, gbsItRev->getReversed() == true);
    gbsItRev->toRight();
  }

}
开发者ID:BioinformaticsArchive,项目名称:hal,代码行数:83,代码来源:halGappedSegmentIteratorTest.cpp


注:本文中的TopSegmentIteratorConstPtr::equals方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。