R coxsurv.fit survfit.coxph“計算引擎”的直接接口

R語言 coxsurv.fit 位於 survival 包(package)。

說明

該程序主要用於允許其他包在‘data’級別而不是‘user’級別調用survfit.coxph函數。它不對提供的輸入數據進行檢查，如果數據錯誤，可能會導致意外錯誤。

用法

coxsurv.fit(ctype, stype, se.fit, varmat, cluster, 
            y, x, wt, risk, position, strata, oldid,
            y2, x2, risk2, strata2, id2, unlist=TRUE)

參數

`stype`	生存曲線計算：1=直接，2=exp(-累積風險)
`ctype`	累積危險計算：1=Breslow，2=Efron
`se.fit`	如果為 TRUE，則計算標準誤差
`varmat`	係數的方差矩陣
`cluster`	控製穩健方差的向量
`y`	Cox 模型中使用的響應變量。 (當然刪除了缺失值。)
`x`	Cox 模型中使用的協變量矩陣
`wt`	Cox 模型的權重向量。如果模型未加權，則使用 1 的向量。
`risk`	來自擬合 Cox 模型的風險評分 exp(X beta + offset)。
`position`	可選參數控製什麽算作'censored'。例如，由於時間相關的協變量，受試者的開始時間和停止時間可能為 (1,5)(5,30)(30,100)。 5 次和 30 次不是 'real' 審查。位置為 1 表示真正開始，2 表示實際結束，3 表示兩者，0 表示兩者都不是。
`strata`	Cox 模型中使用的層變量。這將是一個因子。
`oldid`	原始數據中具有多行的受試者的標識符。
`y2` , `x2` , `risk2` , `strata2`	需要預測的假設受試者的變量
`id2`	可選的;如果存在且不為 NULL，則這應該是長度為 `nrow(x2)` 的標識符向量。非空值表示 `x2` 包含時間相關協變量，在這種情況下，它標識 `x2` 的哪些行與每個主題相關。
`unlist`	如果`FALSE`，結果將是一個列表，每一層都有一個元素。否則，各層將以“unpacked” 的形式呈現在`survfit` 對象中。

值

包含 survfit 對象的幾乎所有組件的列表。所缺少的隻是添加置信區間、原始模型響應的類型(如在 coxph 對象中)和類。

注意

該函數和 survfit.coxph 的源代碼都是使用 noweb 編寫的。有關完整文檔，請參閱inst/sourcecode.pdf 文件。

作者

Terry Therneau

也可以看看

survfit.coxph

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 A direct interface to the ‘computational engine’ of survfit.coxph。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。