R identify.hclust 識別樹狀圖中的簇

說明

identify.hclust 在按下(第一個)鼠標按鈕時讀取圖形指針的位置。然後，它在指針的垂直位置處剪切樹，並突出顯示包含指針的水平位置的簇。可選地，將函數應用於簇中包含的數據點的索引。

用法

## S3 method for class 'hclust'
identify(x, FUN = NULL, N = 20, MAXCLUSTER = 20, DEV.FUN = NULL,
          ...)

參數

x	hclust 生成的類型的對象。
FUN	(可選)應用於集群中數據點的索引號的函數(請參閱下麵的“詳細信息”)。
N	要識別的最大簇數。
MAXCLUSTER	切割可以產生的最大簇數(限製指針的有效垂直範圍)。
DEV.FUN	(可選)整數標量。如果指定，則在應用 FUN 之前激活相應的圖形設備。
...	FUN 的進一步參數。

細節

默認情況下，可以使用鼠標識別簇，並返回相應數據點索引的 invisible 列表。

如果 FUN 不是 NULL ，則數據點的索引向量將作為第一個參數傳遞給此函數，請參閱下麵的示例。可以使用 DEV.FUN 指定 FUN 的活動圖形設備。

按除第一個以外的任何鼠標按鈕即可終止識別過程，另請參閱identify。

值

數據點索引向量列表或 FUN 返回值列表。

例子

## Not run: 
require(graphics)

hca <- hclust(dist(USArrests))
plot(hca)
(x <- identify(hca)) ##  Terminate with 2nd mouse button !!

hci <- hclust(dist(iris[,1:4]))
plot(hci)
identify(hci, function(k) print(table(iris[k,5])))

# open a new device (one for dendrogram, one for bars):
dev.new() # << make that narrow (& small)
          # and *beside* 1st one
nD <- dev.cur()            # to be for the barplot
dev.set(dev.prev())  # old one for dendrogram
plot(hci)
## select subtrees in dendrogram and "see" the species distribution:
identify(hci, function(k) barplot(table(iris[k,5]), col = 2:4), DEV.FUN = nD)

## End(Not run)

也可以看看

hclust , rect.hclust