R pairs.lme lme 對象的對圖

說明

獲得線性混合效應擬合的診斷圖。 form 參數為繪圖規範類型提供了相當大的靈活性。根據網格顯示，條件表達式(位於 | 運算符的右側)始終意味著針對條件因子的每個級別使用不同的麵板。公式右側的表達式(在 | 運算符之前)的計算結果必須為至少包含兩列的 DataFrame 。如果 DataFrame 有兩列，則顯示兩個變量的散點圖(使用網格函數xyplot)。否則，如果存在兩列以上，則顯示 DataFrame 中各列的成對散點圖的散點圖矩陣(使用網格函數splom)。

用法

## S3 method for class 'lme'
pairs(x, form, label, id, idLabels, grid, ...)

參數

x	繼承自類 "lme" 的對象，表示擬合的線性混合效果模型。
form	一個可選的單邊公式，指定所需的繪圖類型。可以引用用於獲取x的原始數據幀中存在的任何變量。另外，x本身可以在公式中使用符號"."引用。 | 運算符右側的條件表達式可用於定義網格顯示中的單獨麵板。 form 右側和 | 運算符左側的表達式的計算結果必須為至少包含兩列的 DataFrame 。默認值為 ~ coef(.) ，對應於在嵌套的最內層評估的係數的對圖。
label	成對圖中變量的標簽的可選字符向量。
id	可選數值或片麵公式。如果作為值給出，則它將用作基於估計隨機效應的馬哈拉諾比斯距離的異常值檢驗的顯著性水平。使用 idLabels 在圖中識別隨機效應距離大於適當卡方分布的 1-value 百分位數的組。如果作為單邊公式給出，則其右側必須求值為邏輯向量、整數向量或字符向量，用於標識圖中的點。如果缺失，則不會識別任何點。
idLabels	可選向量或片麵公式。如果作為向量給出，它將轉換為字符並用於標記根據 id 標識的點。如果作為單邊公式給出，則其右側必須計算為一個向量，該向量將轉換為字符並用於標記已識別的點。默認值是最裏麵的分組因子。
grid	一個可選的邏輯值，指示是否應將網格添加到繪圖中。默認為 FALSE 。
...	傳遞給網格圖函數的可選參數。

值

診斷格子圖。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)

# scatter plot of coefficients by gender, identifying unusual subjects
pairs(fm1, ~coef(., augFrame = TRUE) | Sex, id = 0.1, adj = -0.5)    

# scatter plot of estimated random effects :
pairs(fm1, ~ranef(.))

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

也可以看看

lme、pairs.compareFits、pairs.lmList、xyplot、splom