本文整理匯總了Python中Classifier.Classifier.learn_SVM_model方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python Classifier.learn_SVM_model方法的具體用法？Python Classifier.learn_SVM_model怎麽用？Python Classifier.learn_SVM_model使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類Classifier.Classifier的用法示例。
在下文中一共展示了Classifier.learn_SVM_model方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: cmdline_parser
# 需要導入模塊: from Classifier import Classifier [as 別名]
# 或者: from Classifier.Classifier import learn_SVM_model [as 別名]
dest="queries",
required=False)
parser.add_argument("-c", dest="C", required=False)
return parser
model = None
if __name__ == "__main__":
parser = cmdline_parser()
args = parser.parse_args()
gta = list(SeqIO.parse(args.gta, "fasta"))
viral = list(SeqIO.parse(args.viral, "fasta"))
model = Classifier(gta, viral)
queries = args.queries.split(',')
for query in queries:
query_seqs = list(SeqIO.parse(query, "fasta"))
gene_num = int(query[query.find('orfg')+4])
if not model:
# dist_matrix = parse_dists.get_dist_matrix(gene_num)
model = Classifier(gta, viral)
model.get_training_set()
# model.get_weights()
SVs = model.learn_SVM_model(float(args.C))
print model.classify(query_seqs)[1]