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Python NetworkX to_pandas_adjacency用法及代码示例


本文简要介绍 networkx.convert_matrix.to_pandas_adjacency 的用法。

用法:

to_pandas_adjacency(G, nodelist=None, dtype=None, order=None, multigraph_weight=<built-in function sum>, weight='weight', nonedge=0.0)

将图形邻接矩阵作为 Pandas DataFrame 返回。

参数

G图形

用于构建 Pandas DataFrame 的 NetworkX 图。

nodelist列表,可选

行和列根据 nodelist 中的节点进行排序。如果nodelist 为无,则排序由 G.nodes() 生成。

multigraph_weight{sum, min, max},可选

确定如何处理多重图中的权重的运算符。默认是对多条边的权重求和。

weight字符串或无,可选

保存用于边权重的数值的边属性。如果边不具有该属性,则使用值 1 代替。

nonedge浮点数,可选

对应于非边的矩阵值通常设置为零。但是,如果存在对应于实际边的矩阵值也为零,则这可能是不希望的。如果是这样,人们可能更喜欢非边具有一些其他值,例如 nan。

返回

df Pandas DataFrame

图邻接矩阵

注意

对于有向图,条目 i,j 对应于从 i 到 j 的边。

DataFrame 条目分配给权重边属性。当边没有权重属性时,条目的值设置为数字 1。对于多个(平行)边,条目的值由 ‘multigraph_weight’ 参数确定。默认是对每个平行边的权重属性求和。

nodelist 不包含 G 中的每个节点时,该矩阵由 G 的子图构建,该子图由 nodelist 中的节点诱导。

用于图中自循环边的约定是将对角矩阵条目值分配给边的权重属性(如果边没有权重属性,则为数字 1)。如果需要将边权重加倍的替代约定,则可以将生成的 Pandas DataFrame 修改如下:

>>> import pandas as pd
>>> pd.options.display.max_columns = 20
>>> import numpy as np
>>> G = nx.Graph([(1, 1)])
>>> df = nx.to_pandas_adjacency(G, dtype=int)
>>> df
   1
1  1
>>> df.values[np.diag_indices_from(df)] *= 2
>>> df
   1
1  2

例子

>>> G = nx.MultiDiGraph()
>>> G.add_edge(0, 1, weight=2)
0
>>> G.add_edge(1, 0)
0
>>> G.add_edge(2, 2, weight=3)
0
>>> G.add_edge(2, 2)
1
>>> nx.to_pandas_adjacency(G, nodelist=[0, 1, 2], dtype=int)
   0  1  2
0  0  2  0
1  1  0  0
2  0  0  4

相关用法


注:本文由纯净天空筛选整理自networkx.org大神的英文原创作品 networkx.convert_matrix.to_pandas_adjacency。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。