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Python SimpleNamespace.pheno_ids方法代码示例

本文整理汇总了Python中types.SimpleNamespace.pheno_ids方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python SimpleNamespace.pheno_ids方法的具体用法?Python SimpleNamespace.pheno_ids怎么用?Python SimpleNamespace.pheno_ids使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在types.SimpleNamespace的用法示例。


在下文中一共展示了SimpleNamespace.pheno_ids方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: get_variant_summary_record

# 需要导入模块: from types import SimpleNamespace [as 别名]
# 或者: from types.SimpleNamespace import pheno_ids [as 别名]
def get_variant_summary_record(line):
    line = line.rstrip()
    line_list = line.split("\t")
    record = SimpleNamespace()

    record.assembly = line_list[12]
    record.chrom = line_list[13]
    record.start = line_list[14]
    record.end = line_list[15]
    record.ref = line_list[25]
    record.alt = line_list[26]
    record.nsv = line_list[7]
    record.gene_id = line_list[3]
    record.pheno_ids = line_list[10]

    record.rcvs = line_list[8].split(";")
    record.rs = "rs{}".format(line_list[6])
    record.allele = "{}/{}".format(record.ref, record.alt)

    return record
开发者ID:EBIvariation,项目名称:eva-cttv-pipeline,代码行数:22,代码来源:get_coords_allele_clinvar.py


注:本文中的types.SimpleNamespace.pheno_ids方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。