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Python PrepTemplate.to_dataframe方法代码示例

本文整理汇总了Python中qiita_db.metadata_template.PrepTemplate.to_dataframe方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PrepTemplate.to_dataframe方法的具体用法?Python PrepTemplate.to_dataframe怎么用?Python PrepTemplate.to_dataframe使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在qiita_db.metadata_template.PrepTemplate的用法示例。


在下文中一共展示了PrepTemplate.to_dataframe方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_dataframe_from_template

# 需要导入模块: from qiita_db.metadata_template import PrepTemplate [as 别名]
# 或者: from qiita_db.metadata_template.PrepTemplate import to_dataframe [as 别名]
    def test_dataframe_from_template(self):
        template = PrepTemplate(1)
        obs = template.to_dataframe()

        # 27 samples
        self.assertEqual(len(obs), 27)
        self.assertTrue(set(obs.index), {
            u'SKB1.640202', u'SKB2.640194', u'SKB3.640195', u'SKB4.640189',
            u'SKB5.640181', u'SKB6.640176', u'SKB7.640196', u'SKB8.640193',
            u'SKB9.640200', u'SKD1.640179', u'SKD2.640178', u'SKD3.640198',
            u'SKD4.640185', u'SKD5.640186', u'SKD6.640190', u'SKD7.640191',
            u'SKD8.640184', u'SKD9.640182', u'SKM1.640183', u'SKM2.640199',
            u'SKM3.640197', u'SKM4.640180', u'SKM5.640177', u'SKM6.640187',
            u'SKM7.640188', u'SKM8.640201', u'SKM9.640192'})

        self.assertTrue(set(obs.columns), {
            u'tot_org_carb', u'common_name', u'has_extracted_data',
            u'required_sample_info_status', u'water_content_soil',
            u'env_feature', u'assigned_from_geo', u'altitude', u'env_biome',
            u'texture', u'has_physical_specimen', u'description_duplicate',
            u'physical_location', u'latitude', u'ph', u'host_taxid',
            u'elevation', u'description', u'collection_timestamp',
            u'taxon_id', u'samp_salinity', u'host_subject_id', u'sample_type',
            u'season_environment', u'temp', u'country', u'longitude',
            u'tot_nitro', u'depth', u'anonymized_name', u'target_subfragment',
            u'sample_center', u'samp_size', u'run_date', u'experiment_center',
            u'pcr_primers', u'center_name', u'barcodesequence', u'run_center',
            u'run_prefix', u'library_construction_protocol', u'emp_status',
            u'linkerprimersequence', u'experiment_design_description',
            u'target_gene', u'center_project_name', u'illumina_technology',
            u'sequencing_meth', u'platform', u'experiment_title',
            u'study_center'})
开发者ID:jenwei,项目名称:qiita,代码行数:34,代码来源:test_util.py


注:本文中的qiita_db.metadata_template.PrepTemplate.to_dataframe方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。