本文整理汇总了Python中qiita_db.metadata_template.PrepTemplate.create_qiime_mapping_file方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python PrepTemplate.create_qiime_mapping_file方法的具体用法？Python PrepTemplate.create_qiime_mapping_file怎么用？Python PrepTemplate.create_qiime_mapping_file使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类qiita_db.metadata_template.PrepTemplate的用法示例。
在下文中一共展示了PrepTemplate.create_qiime_mapping_file方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: SQLConnectionHandler
# 需要导入模块: from qiita_db.metadata_template import PrepTemplate [as 别名]
# 或者: from qiita_db.metadata_template.PrepTemplate import create_qiime_mapping_file [as 别名]
# 23 Nov, 2014
# This patch creates all the qiime mapping files for the existing
# prep templates
from qiita_db.util import get_mountpoint
from qiita_db.sql_connection import SQLConnectionHandler
from qiita_db.metadata_template import PrepTemplate
conn_handler = SQLConnectionHandler()
_id, fp_base = get_mountpoint('templates')[0]
for prep_template_id in conn_handler.execute_fetchall(
"SELECT prep_template_id FROM qiita.prep_template"):
prep_template_id = prep_template_id[0]
pt = PrepTemplate(prep_template_id)
study_id = pt.study_id
for _, fpt in pt.get_filepaths():
pt.create_qiime_mapping_file(fpt)