本文整理汇总了Python中puzzle.plugins.VcfPlugin.db方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python VcfPlugin.db方法的具体用法？Python VcfPlugin.db怎么用？Python VcfPlugin.db使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类puzzle.plugins.VcfPlugin的用法示例。
在下文中一共展示了VcfPlugin.db方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: select_plugin
# 需要导入模块: from puzzle.plugins import VcfPlugin [as 别名]
# 或者: from puzzle.plugins.VcfPlugin import db [as 别名]
def select_plugin(self, case_obj):
"""Select and initialize the correct plugin for the case."""
if case_obj.variant_mode == 'vcf':
logger.debug("Using vcf plugin")
plugin = VcfPlugin(vtype=case_obj.variant_type)
elif case_obj.variant_mode == 'gemini':
logger.debug("Using gemini plugin")
plugin = GeminiPlugin(vtype=case_obj.variant_type)
plugin.db = case_obj.variant_source
plugin.case_objs = [case_obj]
self.variant_type = case_obj.variant_type
case_id = case_obj.case_id
return plugin, case_id