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Python VcfPlugin._add_most_severe_consequence方法代码示例

本文整理汇总了Python中puzzle.plugins.VcfPlugin._add_most_severe_consequence方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python VcfPlugin._add_most_severe_consequence方法的具体用法?Python VcfPlugin._add_most_severe_consequence怎么用?Python VcfPlugin._add_most_severe_consequence使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在puzzle.plugins.VcfPlugin的用法示例。


在下文中一共展示了VcfPlugin._add_most_severe_consequence方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_add_most_severe

# 需要导入模块: from puzzle.plugins import VcfPlugin [as 别名]
# 或者: from puzzle.plugins.VcfPlugin import _add_most_severe_consequence [as 别名]
def test_add_most_severe(variant):
    plugin = VcfPlugin()
    
    variant.consequences = ['downstream_gene_variant', 'stop_gained']
    plugin._add_most_severe_consequence(variant)
    
    assert variant.most_severe_consequence == 'stop_gained'
开发者ID:J35P312,项目名称:puzzle,代码行数:9,代码来源:test_consequence_extras.py

示例2: test_add_most_severe_no_info

# 需要导入模块: from puzzle.plugins import VcfPlugin [as 别名]
# 或者: from puzzle.plugins.VcfPlugin import _add_most_severe_consequence [as 别名]
def test_add_most_severe_no_info(variant):
    plugin = VcfPlugin()
    plugin._add_most_severe_consequence(variant)
    
    assert variant.most_severe_consequence == None
开发者ID:J35P312,项目名称:puzzle,代码行数:7,代码来源:test_consequence_extras.py


注:本文中的puzzle.plugins.VcfPlugin._add_most_severe_consequence方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。