本文整理汇总了Python中puzzle.plugins.GeminiPlugin._get_transcripts方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python GeminiPlugin._get_transcripts方法的具体用法?Python GeminiPlugin._get_transcripts怎么用?Python GeminiPlugin._get_transcripts使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类puzzle.plugins.GeminiPlugin
的用法示例。
在下文中一共展示了GeminiPlugin._get_transcripts方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_get_transcripts
# 需要导入模块: from puzzle.plugins import GeminiPlugin [as 别名]
# 或者: from puzzle.plugins.GeminiPlugin import _get_transcripts [as 别名]
def test_get_transcripts(gemini_path):
adapter = GeminiPlugin(db=gemini_path)
gemini_variant = {'variant_id': 1}
transcripts = []
for transcript in adapter._get_transcripts(gemini_variant):
transcripts.append(transcript)
assert len(transcripts) == 2
first_transcript = transcripts[0]
assert first_transcript.transcript_id == 'ENST00000370383'
assert first_transcript.hgnc_symbol == 'EPHX4'
assert first_transcript.consequence == 'missense_variant'
assert first_transcript.ensembl_id == None
assert first_transcript.biotype == 'protein_coding'
assert first_transcript.sift == 'deleterious'
assert first_transcript.polyphen == 'probably_damaging'