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Python GeminiPlugin._add_transcripts方法代码示例

本文整理汇总了Python中puzzle.plugins.GeminiPlugin._add_transcripts方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python GeminiPlugin._add_transcripts方法的具体用法?Python GeminiPlugin._add_transcripts怎么用?Python GeminiPlugin._add_transcripts使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在puzzle.plugins.GeminiPlugin的用法示例。


在下文中一共展示了GeminiPlugin._add_transcripts方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_add_transcripts

# 需要导入模块: from puzzle.plugins import GeminiPlugin [as 别名]
# 或者: from puzzle.plugins.GeminiPlugin import _add_transcripts [as 别名]
    def test_add_transcripts(self, gemini_case_obj, variant):
        adapter = GeminiPlugin()
        adapter.add_case(gemini_case_obj)
        adapter.db = gemini_case_obj.variant_source
    
        gemini_variant = {'variant_id': 1}
        adapter._add_transcripts(variant, gemini_variant)
        
        transcripts = variant.transcripts
        
        assert len(transcripts) == 2

        first_transcript = transcripts[0]

        assert first_transcript.transcript_id == 'ENST00000370383'
        assert first_transcript.hgnc_symbol == 'EPHX4'
        assert first_transcript.consequence == 'missense_variant'
        assert first_transcript.ensembl_id == None
        assert first_transcript.biotype == 'protein_coding'
        assert first_transcript.sift == 'deleterious'
        assert first_transcript.polyphen == 'probably_damaging'
开发者ID:J35P312,项目名称:puzzle,代码行数:23,代码来源:test_gemini_variant_extras.py


注:本文中的puzzle.plugins.GeminiPlugin._add_transcripts方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。