本文整理汇总了Python中msmbuilder.msm.MarkovStateModel.score方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MarkovStateModel.score方法的具体用法？Python MarkovStateModel.score怎么用？Python MarkovStateModel.score使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类msmbuilder.msm.MarkovStateModel的用法示例。
在下文中一共展示了MarkovStateModel.score方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_score_1
# 需要导入模块: from msmbuilder.msm import MarkovStateModel [as 别名]
# 或者: from msmbuilder.msm.MarkovStateModel import score [as 别名]
def test_score_1():
# test that GMRQ is equal to the sum of the first n eigenvalues,
# when testing and training on the same dataset.
sequence = [0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 1, 1, 1,
0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 0, 0]
for n in [0, 1, 2]:
model = MarkovStateModel(verbose=False, n_timescales=n)
model.fit([sequence])
assert_approx_equal(model.score([sequence]), model.eigenvalues_.sum())
assert_approx_equal(model.score([sequence]), model.score_)