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Python MarkovStateModel.sample方法代码示例

本文整理汇总了Python中msmbuilder.msm.MarkovStateModel.sample方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python MarkovStateModel.sample方法的具体用法?Python MarkovStateModel.sample怎么用?Python MarkovStateModel.sample使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在msmbuilder.msm.MarkovStateModel的用法示例。


在下文中一共展示了MarkovStateModel.sample方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_11

# 需要导入模块: from msmbuilder.msm import MarkovStateModel [as 别名]
# 或者: from msmbuilder.msm.MarkovStateModel import sample [as 别名]
def test_11():
    # test sample
    model = MarkovStateModel()
    model.fit([[0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 2, 2, 0, 0]])
    sample = model.sample(n_steps=1000, random_state=0)
    assert isinstance(sample, np.ndarray)
    assert len(sample) == 1000

    bc = np.bincount(sample)
    diff = model.populations_ - (bc / np.sum(bc))

    assert np.sum(np.abs(diff)) < 0.1
开发者ID:schwancr,项目名称:msmbuilder,代码行数:14,代码来源:test_msm.py


注:本文中的msmbuilder.msm.MarkovStateModel.sample方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。