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Python CoxPHFitter._get_efron_values方法代码示例

本文整理汇总了Python中lifelines.estimation.CoxPHFitter._get_efron_values方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python CoxPHFitter._get_efron_values方法的具体用法?Python CoxPHFitter._get_efron_values怎么用?Python CoxPHFitter._get_efron_values使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在lifelines.estimation.CoxPHFitter的用法示例。


在下文中一共展示了CoxPHFitter._get_efron_values方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_efron_computed_by_hand_examples

# 需要导入模块: from lifelines.estimation import CoxPHFitter [as 别名]
# 或者: from lifelines.estimation.CoxPHFitter import _get_efron_values [as 别名]
    def test_efron_computed_by_hand_examples(self, data_nus):
        cox = CoxPHFitter()

        X = data_nus['x'][:, None]
        T = data_nus['t']
        E = data_nus['E']

        # Enforce numpy arrays
        X = np.array(X)
        T = np.array(T)
        E = np.array(E)

        # Want as bools
        E = E.astype(bool)

        # tests from http://courses.nus.edu.sg/course/stacar/internet/st3242/handouts/notes3.pdf
        beta = np.array([[0]])

        l, u = cox._get_efron_values(X, beta, T, E)
        l = -l

        assert np.abs(l[0][0] - 77.13) < 0.05
        assert np.abs(u[0] - -2.51) < 0.05
        beta = beta + u / l
        assert np.abs(beta - -0.0326) < 0.05

        l, u = cox._get_efron_values(X, beta, T, E)
        l = -l

        assert np.abs(l[0][0] - 72.83) < 0.05
        assert np.abs(u[0] - -0.069) < 0.05
        beta = beta + u / l
        assert np.abs(beta - -0.0325) < 0.01

        l, u = cox._get_efron_values(X, beta, T, E)
        l = -l

        assert np.abs(l[0][0] - 72.70) < 0.01
        assert np.abs(u[0] - -0.000061) < 0.01
        beta = beta + u / l
        assert np.abs(beta - -0.0335) < 0.01
开发者ID:nerdless,项目名称:lifelines,代码行数:43,代码来源:test_estimation.py


注:本文中的lifelines.estimation.CoxPHFitter._get_efron_values方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。