本文整理汇总了Python中ij.ImagePlus.getOverlay方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python ImagePlus.getOverlay方法的具体用法？Python ImagePlus.getOverlay怎么用？Python ImagePlus.getOverlay使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ij.ImagePlus的用法示例。
在下文中一共展示了ImagePlus.getOverlay方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: remove_outside_cell
# 需要导入模块: from ij import ImagePlus [as 别名]
# 或者: from ij.ImagePlus import getOverlay [as 别名]
#print(rest.getColumnHeadings())
remove_outside_cell(rest,mask)
rest.save(directory+"/"+filename+"_results.csv" )
else:
rest = rt
image.setDimensions(2, z_slices, 1)
image.setOpenAsHyperStack(True)
print(image.isHyperStack(), image.getNChannels(), image.getOverlay())
#image.flattenStack()
image.show()
fs = FileSaver(image)
filepath = directory + "/" + filename + "_coloc.tiff"
fs.saveAsTiff(filepath)
image.close()
image = IJ.getImage()
IJ.run(image_dapi,"Convert to Mask", "method=Otsu background=Default calculate")
fs = FileSaver(image_dapi)
filepath = directory + "/" + filename + "_dapi.tiff"
fs.saveAsTiff(filepath)