本文整理汇总了Python中ij.ImagePlus.getDimensions方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python ImagePlus.getDimensions方法的具体用法？Python ImagePlus.getDimensions怎么用？Python ImagePlus.getDimensions使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ij.ImagePlus的用法示例。
在下文中一共展示了ImagePlus.getDimensions方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: ImagePlus
# 需要导入模块: from ij import ImagePlus [as 别名]
# 或者: from ij.ImagePlus import getDimensions [as 别名]
image_dapi = ImagePlus("dapi stack", dapi_stack)
image_dapi.show()
image_green = ImagePlus("green stack", green_stack)
image_green.show()
image = ImagePlus("two channel stack", twochannel_stack)
image.show()
if auto_thresh:
con = ImageConverter(image)
con.convertToGray8()
IJ.run(image, "Auto Local Threshold", "method=Bernsen radius=15 parameter_1=0 parameter_2=0 white stack")
#image = CompositeImage(image_two)
#image = IJ.getImage()
z_slices = image.getDimensions()[3] / 2
print("order=xyczt(default) channels=2 slices="+ str(z_slices) + " frames=1 display=Color", image.getDimensions())
image_two = HyperStackConverter.toHyperStack(image,2,z_slices,1)
image = CompositeImage(image_two)
image.show()
rt = run_comdet(image)
rt.save(directory+"/"+filename+"_results.csv" )
image = IJ.getImage()
if auto_cell:
mask = generate_mask(image_green, auto_cell_thresh)
fs = FileSaver(mask)
filepath = directory + "/" + filename + "_mask.tiff"