本文整理汇总了Python中htmd.molecule.molecule.Molecule.boxangles方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.boxangles方法的具体用法？Python Molecule.boxangles怎么用？Python Molecule.boxangles使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类htmd.molecule.molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.boxangles方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: home
# 需要导入模块: from htmd.molecule.molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from htmd.molecule.molecule.Molecule import boxangles [as 别名]
for ext in _MDTRAJ_SAVERS:
if ext not in _WRITERS:
_WRITERS[ext] = MDTRAJwrite
if __name__ == '__main__':
from htmd.home import home
from htmd.molecule.molecule import Molecule, mol_equal
from htmd.util import tempname
import numpy as np
import os
testfolder = home(dataDir='metricdistance')
mol = Molecule(os.path.join(testfolder, 'filtered.pdb'))
mol.coords = np.tile(mol.coords, (1, 1, 2))
mol.filter('protein and resid 1 to 20')
mol.boxangles = np.ones((3, 2), dtype=np.float32) * 90
mol.box = np.ones((3, 2), dtype=np.float32) * 15
mol.step = np.arange(2)
mol.time = np.arange(2) * 1E5
for ext in _WRITERS:
tmp = tempname(suffix='.'+ext)
mol.write(tmp)
print('Can write {} files'.format(ext))
# from difflib import Differ
# d = Differ()
#
# with open(tmp, 'rb') as f1, open(a, 'rb') as f2:
# res = d.compare([x.decode('utf8') for x in f1.readlines()], [x.decode('utf8') for x in f2.readlines()])