本文整理汇总了Python中Sire.System.removeAllConstraints方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python System.removeAllConstraints方法的具体用法？Python System.removeAllConstraints怎么用？Python System.removeAllConstraints使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Sire.System的用法示例。
在下文中一共展示了System.removeAllConstraints方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: SpaceWrapper
# 需要导入模块: from Sire import System [as 别名]
# 或者: from Sire.System import removeAllConstraints [as 别名]
# Add the protein, ligand and water
inter_cljff.add(protein)
inter_cljff.add(ligand)
inter_cljff.add(water)
# Add the forcefields to the system
system.add(intra_cljff)
system.add(intraff)
system.add(inter_cljff)
# Set the expression used to calculate the total energy
# of the system
system.setComponent( system.totalComponent(),
intra_cljff.components().total() +
intraff.components().total() +
inter_cljff.components().total() )
# Tell the system about the periodic box
system.setProperty("space", space)
# now wrap everything so that the ligand is in the center of the box
system.add( SpaceWrapper(ligand_mol.evaluate().center(), all) )
system.applyConstraints()
system.removeAllConstraints()
# Save a binary representation of the system
# to the file "system.s3"
import Sire.Stream
Sire.Stream.save( system, "system.s3" )