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Python System.clearStatistics方法代码示例

本文整理汇总了Python中Sire.System.clearStatistics方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python System.clearStatistics方法的具体用法?Python System.clearStatistics怎么用?Python System.clearStatistics使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Sire.System的用法示例。


在下文中一共展示了System.clearStatistics方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: print

# 需要导入模块: from Sire import System [as 别名]
# 或者: from Sire.System import clearStatistics [as 别名]
            lj_mol = lj_mol.atom(atoms[j].index()).edit() \
                           .setProperty("b-factor",beta_ljnrg).molecule().commit()

            total_mol = total_mol.atom(atoms[j].index()).edit() \
                                 .setProperty("b-factor",beta_total).molecule().commit()

        coul_group.update(coul_mol)
        lj_group.update(lj_mol)
        total_group.update(total_mol)

    print("Total energies: %f  %f  %f" % (cnrg, ljnrg, cnrg+ljnrg))

    PDB().write(coul_group, "test_coul_%0004d.pdb" % id)
    PDB().write(lj_group, "test_lj_%0004d.pdb" % id)
    PDB().write(total_group, "test_total_%0004d.pdb" % id)

print("Running a simulation...")

for i in range(1,11):
    system = moves.move(system, 2000, True)

    nrgmon = system.monitor( MonitorName("solute_shell") )

    PDB().write(system.molecules(), "test_sim_%0004d.pdb" % i)

    system.clearStatistics()

    print("Step %d of 10: Energy = %s" % (i, system.energy()))

    view(nrgmon, i)
开发者ID:Alwnikrotikz,项目名称:sire,代码行数:32,代码来源:energymonitor.py


注:本文中的Sire.System.clearStatistics方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。