本文整理汇总了Python中Sire.System.clearStatistics方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python System.clearStatistics方法的具体用法?Python System.clearStatistics怎么用?Python System.clearStatistics使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Sire.System
的用法示例。
在下文中一共展示了System.clearStatistics方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: print
# 需要导入模块: from Sire import System [as 别名]
# 或者: from Sire.System import clearStatistics [as 别名]
lj_mol = lj_mol.atom(atoms[j].index()).edit() \
.setProperty("b-factor",beta_ljnrg).molecule().commit()
total_mol = total_mol.atom(atoms[j].index()).edit() \
.setProperty("b-factor",beta_total).molecule().commit()
coul_group.update(coul_mol)
lj_group.update(lj_mol)
total_group.update(total_mol)
print("Total energies: %f %f %f" % (cnrg, ljnrg, cnrg+ljnrg))
PDB().write(coul_group, "test_coul_%0004d.pdb" % id)
PDB().write(lj_group, "test_lj_%0004d.pdb" % id)
PDB().write(total_group, "test_total_%0004d.pdb" % id)
print("Running a simulation...")
for i in range(1,11):
system = moves.move(system, 2000, True)
nrgmon = system.monitor( MonitorName("solute_shell") )
PDB().write(system.molecules(), "test_sim_%0004d.pdb" % i)
system.clearStatistics()
print("Step %d of 10: Energy = %s" % (i, system.energy()))
view(nrgmon, i)