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Python System.constraintsSatisfied方法代码示例

本文整理汇总了Python中Sire.System.constraintsSatisfied方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python System.constraintsSatisfied方法的具体用法?Python System.constraintsSatisfied怎么用?Python System.constraintsSatisfied使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Sire.System的用法示例。


在下文中一共展示了System.constraintsSatisfied方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: System

# 需要导入模块: from Sire import System [as 别名]
# 或者: from Sire.System import constraintsSatisfied [as 别名]
system = System()

system.add(qmff)
system.add(intraff)
system.add(intraclj)

system.add(solute)

print(system.energy())

chg_constraint = QMChargeConstraint(solute)
chg_constraint.setChargeCalculator( AM1BCC() )

system.add(chg_constraint)

print(system.constraintsSatisfied())

print(system.energy())

print(system.constraintsSatisfied())

mol = system[ MGIdx(0) ][ mol.number() ].molecule()

print(mol.property("charge").array())

water = PDB().read("test/io/water.pdb")

tip4p = water[ MolIdx(0) ].molecule()
tip4p = protoms.parameterise(tip4p, ProtoMS.SOLVENT)

chgs = tip4p.property("charge")
开发者ID:Alwnikrotikz,项目名称:sire,代码行数:33,代码来源:chargeconstraint.py


注:本文中的Sire.System.constraintsSatisfied方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。