本文整理汇总了Python中MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient.place_parent_energy_files方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python ChopIngredient.place_parent_energy_files方法的具体用法?Python ChopIngredient.place_parent_energy_files怎么用?Python ChopIngredient.place_parent_energy_files使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient
的用法示例。
在下文中一共展示了ChopIngredient.place_parent_energy_files方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_place_parent_energy_files
# 需要导入模块: from MAST.ingredients.chopingredient import ChopIngredient [as 别名]
# 或者: from MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient import place_parent_energy_files [as 别名]
def test_place_parent_energy_files(self):
ingdir="writedir/neb_labelinit-labelfin"
topmetad = MASTFile("files/top_metadata_neb")
topmetad.data.append("origin_dir = %s/files\n" % testdir) #give origin directory
topmetad.to_file("writedir/metadata.txt")
metad = MASTFile("files/metadata_neb")
metad.to_file("%s/metadata.txt" % ingdir)
peinit = MASTFile("files/parent_energy_labelinit")
peinit.to_file("%s/parent_energy_labelinit" % ingdir)
pefin = MASTFile("files/parent_energy_labelfin")
pefin.to_file("%s/parent_energy_labelfin" % ingdir)
kdict=dict()
kdict['mast_kpoints']=[3,3,3,"G"]
kdict['mast_xc']='pbe'
kdict['mast_program']='vasp_neb'
kdict['mast_neb_settings']=dict()
kdict['mast_neb_settings']['images']=3
my_structure=pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/perfect_structure").structure
mywi = ChopIngredient(name=ingdir,program_keys=kdict,structure=my_structure)
os.mkdir(ingdir + '/00')
os.mkdir(ingdir + '/04')
mywi.place_parent_energy_files()
self.assertTrue(os.path.isfile(ingdir + '/00/OSZICAR'))
self.assertTrue(os.path.isfile(ingdir + '/04/OSZICAR'))
oszinit = MASTFile(ingdir + "/00/OSZICAR")
oszfinal = MASTFile(ingdir + "/04/OSZICAR")
self.assertEqual(oszinit.data, peinit.data)
self.assertEqual(oszfinal.data, pefin.data)