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Python ChopIngredient.get_parent_image_structures方法代码示例

本文整理汇总了Python中MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient.get_parent_image_structures方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python ChopIngredient.get_parent_image_structures方法的具体用法?Python ChopIngredient.get_parent_image_structures怎么用?Python ChopIngredient.get_parent_image_structures使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient的用法示例。


在下文中一共展示了ChopIngredient.get_parent_image_structures方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_get_parent_image_structures

# 需要导入模块: from MAST.ingredients.chopingredient import ChopIngredient [as 别名]
# 或者: from MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient import get_parent_image_structures [as 别名]
 def test_get_parent_image_structures(self):
     kdict=dict()
     kdict['mast_program'] = 'vasp_neb'
     neblines = list()
     neblines.append(["Cr","0.0 0.9 0.8","0.0 0.8 0.7"])
     neblines.append(["Cr","0.4 0.2 0.1","0.3 0.3 0.2"])
     neblines.append(["Cr","0.29 0.05 0.05","0.01 0.01 0.98"])
     neblines.append(["Ni","0.61 0.99 0.98","0.25 0.01 0.97"])
     kdict['mast_neb_settings']=dict()
     kdict['mast_neb_settings']['images']=3
     kdict['mast_neb_settings']['lines']=neblines
     ingdir = "writedir/neb_labelinit-labelfin"
     topmetad = MASTFile("files/top_metadata_neb")
     topmetad.to_file("writedir/metadata.txt")
     metad = MASTFile("files/metadata_neb")
     metad.to_file("%s/metadata.txt" % ingdir)
     unsorted_01 = MASTFile("unsorted/parent_structure_labelinit-labelfin_01")
     unsorted_01.to_file("%s/parent_structure_labelinit-labelfin_01" % ingdir)
     unsorted_02 = MASTFile("unsorted/parent_structure_labelinit-labelfin_02")
     unsorted_02.to_file("%s/parent_structure_labelinit-labelfin_02" % ingdir)
     unsorted_03 = MASTFile("unsorted/parent_structure_labelinit-labelfin_03")
     unsorted_03.to_file("%s/parent_structure_labelinit-labelfin_03" % ingdir)
     my_structure=pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/perfect_structure").structure
     mywi = ChopIngredient(name=ingdir,program_keys=kdict,structure=my_structure)
     imstrs = mywi.get_parent_image_structures()
     compare_01 = pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/parent_structure_labelinit-labelfin_01").structure
     compare_02 = pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/parent_structure_labelinit-labelfin_02").structure
     compare_03 = pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/parent_structure_labelinit-labelfin_03").structure
     self.assertEqual(imstrs[0].sites, compare_01.sites)
     self.assertEqual(imstrs[0].lattice, compare_01.lattice)
     self.assertEqual(imstrs[1].sites, compare_02.sites)
     self.assertEqual(imstrs[1].lattice, compare_02.lattice)
     self.assertEqual(imstrs[2].sites, compare_03.sites)
     self.assertEqual(imstrs[2].lattice, compare_03.lattice)
开发者ID:ZhewenSong,项目名称:USIT,代码行数:36,代码来源:test_writeingredient.py


注:本文中的MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient.get_parent_image_structures方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。