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Python ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements方法代码示例

本文整理汇总了Python中MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements方法的具体用法?Python ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements怎么用?Python ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient的用法示例。


在下文中一共展示了ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_give_phonon_multiple_forces_and_displacements

# 需要导入模块: from MAST.ingredients.chopingredient import ChopIngredient [as 别名]
# 或者: from MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient import give_phonon_multiple_forces_and_displacements [as 别名]
 def test_give_phonon_multiple_forces_and_displacements(self):
     ingdir="%s/writedir/single_phonon_label1" % testdir
     recipedir="%s/writedir" % testdir
     topmetad = MASTFile("files/top_metadata_single")
     topmetad.data.append("origin_dir = %s/files\n" % testdir) #give origin directory
     topmetad.to_file("writedir/metadata.txt")
     metad = MASTFile("files/metadata_single_phonon")
     metad.to_file("%s/metadata.txt" % ingdir)
     mypos = MASTFile("files/phonon_initial_POSCAR")
     mypos.to_file("%s/POSCAR" % ingdir)
     kdict=dict()
     kdict['mast_program'] = 'vasp'
     my_structure = pymatgen.io.vaspio.Poscar.from_file("files/perfect_structure").structure
     myxdat=dict()
     mydynmat=dict()
     for subdir in ['phon_01','phon_02','phon_03']:
         os.mkdir("%s/%s" % (ingdir,subdir))
         myxdat[subdir] = MASTFile("files/XDATCAR_%s" % subdir)
         myxdat[subdir].to_file("%s/%s/XDATCAR" % (ingdir,subdir))
         mydynmat[subdir] = MASTFile("files/DYNMAT_%s" % subdir)
         mydynmat[subdir].to_file("%s/%s/DYNMAT" % (ingdir, subdir))
     myuci = ChopIngredient(name=ingdir,program_keys=kdict, structure=my_structure)
     myuci.give_phonon_multiple_forces_and_displacements("next_ingred") 
     newpos = MASTFile("%s/writedir/next_ingred/POSCAR_prePHON" % testdir)
     newdyn = MASTFile("%s/writedir/next_ingred/DYNMAT" % testdir)
     newxdat = MASTFile("%s/writedir/next_ingred/XDATCAR" % testdir)
     comparepos = MASTFile("files/phonon_initial_POSCAR")
     comparedyn = MASTFile("files/DYNMAT_compare")
     comparexdat = MASTFile("%s/XDATCAR" % ingdir)
     self.assertEqual(newpos.data, comparepos.data)
     self.assertEqual(newdyn.data, comparedyn.data)
     self.assertEqual(newxdat.data, comparexdat.data)
开发者ID:ZhewenSong,项目名称:USIT,代码行数:34,代码来源:test_updateingredient.py


注:本文中的MAST.ingredients.chopingredient.ChopIngredient.give_phonon_multiple_forces_and_displacements方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。